Schroedinger: Dokumentacja
From Centrum Komputerów Dużej Mocy, ICM Uniwersytet Warszawski
| Oprogramowanie Schrödinger | |
|---|---|
| Produkt: | wielopakiet |
| Producent: | Schrödinger |
| Licencja: | krajowa, płatna |
| Zainstalowany na: | halo2, lab edukacyjny |
| Wersja: | Suite 2010, Suite 2011 |
| Email: | maria@icm.edu.pl |
| Oprogramowanie Schrödinger w ICM | |
| Nowinki | |
| Zasady licencji 2012 | |
| Zasady licencji 2011 | |
| Zasady licencji 2010 | |
| Uruchamianie | |
| "Gotowe rozwiązania", pomoc | |
| Szkolenia, spotkania, seminaria | |
| Poradniki | |
| Poradnik ICM: Modelowanie biomolekularne (Joanna Trylska, Magdalena Gruziel) | |
| Poradnik ICM: Projektowanie leków (Piotr Setny) | |
| molnet.eu - niezależny portal internetowy poświęcony modelowaniu; redagowany przez Marka Doskocza | |
Dostęp do dokumentacji
Dokumentacja jest dostępna spod interfejsu Maestro - Menu: Help > Manuals, w postaci obszernych interaktywnych pdfów lub Menu: Help > Help... w postaci lokalnej wyszukiwarki.
Z linii komend dokumentacji należy szukać w odpowiednich podkatalogach katalogu $SCHRODINGER/docs.
Dostęp do modułów obliczeniowych spod interfejsu Maestro
Moduły obliczeniowe dostępne są pod zakładką Applications paska menu Maestro. Do wyboru mamy tam: CombiGlide, Epik, Glide, Impact, Jaguar, Liaison, LigPrep, MacroModel, Phase, Prime, QikProp, QSite, SiteMap, Strike, XCluster. Pozostałe aplikacje to tzw. gotowe rozwiązania przygotowane przez Schrodingera - automatyzują wykonanie pewnych typowych zadań, korzystają z programów wymienionych wcześniej.
"Gotowe rozwiązania"
Dostępne są spod interfejsu Maestro, Menu: Applications. Są to gotowe protokoły (z interfejsem) automatyzujące pewne standardowe czynności w procesie "projektowania leku".
- Ligand and Structure Based Descriptors
- Virtual Screening Workflow
- Induced Fit Docking
- QM Polarizable Ligand Docking
