PSI-PRED
From Centrum Komputerów Dużej Mocy, ICM Uniwersytet Warszawski
| PSI-PRED w ICM | |
|---|---|
| Produkt: | PSI-PRED |
| Producent: | D. Jones |
| Licencja: | darmowa do celów akademickich |
| Zainstalowany na: | halo |
| Wersja: | 2.0 |
| Email: | lukas@icm.edu.pl |
| Lista oprogramowania | |
Program do przewidywania struktur drugorzędowych w oparciu o sekwencję białka i ew. baze sekwencji przy zastosowaniu 3-warstwowej ukierowanej sieci neuronowej ze westeczną propagacją błędu. Wyjsciowe przewidywanie rozpoznaje aminokwasy bedace elementami b-wsteg (E), a-helis (H) i rejony nieustrukturowane (C).
Contents |
Ustawienie środowiska:
* use_psipred
Dokumentacja:
- /opt/psipred/README
Referencje:
- Jones DT. (1999) Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices. J. Mol. Biol. 292: 195-202.
Instalacja:
- /opt/psipred
