MedeA: Dostęp do halo2
From Centrum Komputerów Dużej Mocy, ICM Uniwersytet Warszawski
| Oprogramowanie MedeA | |
|---|---|
| Produkt: | MedeA |
| Producent: | Materials Design |
| Licencja: | płatna |
| Zainstalowany na: | lab użytkowników srv-medea1 |
| Wersja: | 2.7.1 |
| Email: | maria@icm.edu.pl |
| Oprogramowanie MedeA w ICM | |
| O pakiecie MedeA | |
| MedeA w ICM | |
| Dostęp do klastra halo2 | |
| Nazapki | |
Informacje ogólne
Z komputerów labuz i srv-medea1 możliwe jest również uruchamianie zadań na klastrze halo2. Użytkowników zainteresowanych korzystaniem z tej możliwości prosimy o dokładne zapoznanie się z informacjami poniżej.
Zadania uruchamiane na halo2 wykonywane są bezpośrednio na wskazanych nodach. Nie są one kolejkowane przy użyciu systemu kolejkowego PBS. Za kolejność wykonywanych zadań odpowiada JobServer - integralna część pakietu MedeA.
Użytkownicy MedeA mają do dyspozycji 7 nodów każdy po 16 procesorów. Utworzone kolejki pozwalają na wykonywanie 14 zadań równolegle.
Dostęp do klastra odbywa się za pośrednictwem kolejek fshalo2-n48-4proc, fshalo-n49-16proc, halo2-4proc-4tasks-n50, halo2-8proc-2task-n51, halo2-16proc-1task-n52, halo2-16proc-1task-n53 i halo2-16proc-1task-n54 (patrz opis niżej). Przy korzystaniu z nich warto pamiętać, że:
- Bardzo ważne! Nie należy kasować zadań, które są ciągle liczone, z kolejek na halo2 przy pomocy zaznaczenia ich w przeglądarce i wybrania delete selected. Zadania tak potraktowane rzeczywiście przestaną być widoczne z poziomu pakietu MedeA, zostaną jednak w systemie kolejkowym i zostaną przeliczone, bez możliwości późniejszego sprawdzenia wyników !!! Jedynym prawidłowym sposobem kasowania swojego zadania jest opcja Control/Stop after this electronic iteration dostępna w okienku statusu zadania w przeglądarce.
- Maksymalny limit czasu trwania pojedynczego zadania jest obecnie ustawiony na 168 godzin (1 tydzień).
- Na klastrze halo możliwe jest wykorzystanie z pakietów Vasp w wersji 4.6 i 5.2.
Szczegółowe informacje o kolejkach
Do dyspozycji użytkowników jest siedem kolejek o podobnej konfiguracji:
- fshalo2-n49-16proc, halo2-n52-16proc, halo2-16proc-1task-n53 i halo2-16proc-1task-n54
- Zadania wstawione do tej kolejki trafią na szesnastoprocesorowe węzły Operon 4 x 4 rdzenie (patrz opis klastra halo2)
- Jako liczbę procesorów (Number of processors w okienku Submit Vasp job) prosimy podawać tylko 16 - JobServer pozwala bowiem dla tych kolejek na uruchomienie jedengo zadania na każdej z nich równolegle, co przy podaniu mniejszej liczby sprawi, że zasoby kolejki nie będą w pełni wykorzystane.
- Na tych kolejkach zalecane jest uruchamianie dużych zadań.
- fshalo-n48-4proc, halo2-8proc-2task-n51 i halo2-4proc-4tasks-n50
- Zadania wstawione do tej kolejki trafią na szesnastoprocesorowe węzły Operon 4 x 4 rdzenie (patrz opis klastra halo2)
- Liczba procesorów podawana pakietowi MedeA (Number of processors w okienku Submit Vasp job) w przypadku kolejki halo2-8proc-2task-n51 powinna być podana - 8 a w przypadku kolejk halo2-4proc-4tasks-n50 i fshalo-n48-4proc - 4 . - JobServer pozwala bowiem dla tych kolejek na uruchomienie dwóch/czterech zadań na każdej z nich równolegle. Podając mniejszą liczbę procesorów zasoby kolejki nie będą w pełni wykorzystane.
