Views

LIGIN

From Centrum Komputerów Dużej Mocy, ICM Uniwersytet Warszawski

Jump to: navigation, search
LIGIN w ICM
Produkt: LIGIN
Producent: Sobolev, V., Wade, R.C., Vriend, G. & Edelman, M.
Licencja: darmowa do celów akademickich
Zainstalowany na: amonit, kabestan
Wersja: 1.0
Email: lukas@icm.edu.pl
Lista oprogramowania

Program LIGIN sluzy do wyszukiwania miejsc wiazacych ligandy w znanych strukturach biomolekularnych w oparciu o komplementarnosc powierzchni. Ponadto program pozwala na znalezienie mozliwych sposobow wiazania sie ligandu do bialka, ktore niekoniecznie musi byc traktowane jako sztywne.

Contents

Ustawienie srodowiska:

   * use_ligin


Dokumentacja:


Referencje:

  • Sobolev, V., Wade, R.C., Vriend, G., Edelman, M. (1996) Molecular docking using surface complementarity. Proteins 25, 120-129.
  • Sobolev, V., Sorokine, A., Prilusky, J., Abola, E.E., Edelman, M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics 15, 327-332.


Instalacja:

  • /opt/ligin