Jackal
From Centrum Komputerów Dużej Mocy, ICM Uniwersytet Warszawski
| BLAST w ICM | |
|---|---|
| Produkt: | Jackal |
| Producent: | Honig Lab |
| Licencja: | darmowa do celów akademickich |
| Zainstalowany na: | halo |
| Wersja: | 1.5 |
| Email: | lukas@icm.edu.pl |
| Lista oprogramowania | |
Pakiet programów do modelowania białek. W skład pakietu wchodzą programy: nest (modelowanie homologiczne), scap (modelowanie łańcuchów bocznych), loopy (modelowanie pętli), profix (rekonstrukcja brakujących atomów/ aminokwasow/ łańcuchów bocznych), ctrip (rekonstrukcja białka na podstawie struktury CA), addh (rekonstrukcja protonów), conref (refinement struktury z ustalonymi więzami), minst (optymalizacja struktury kryterium energetycznym).
Contents |
Ustawienie środowiska:
* use_jackal
Dokumentacja:
- http://trantor.bioc.columbia.edu/programs/jackal/
- more /opt/jackal/doc/Jackalmanual.pdf
Referencje:
- BRAK
Instalacja:
- /opt/jackal
