ECEPPAK
From Centrum Komputerów Dużej Mocy, ICM Uniwersytet Warszawski
| ECEPPAK w ICM | |
|---|---|
| Produkt: | ECEPPAK |
| Producent: | |
| Licencja: | darmowa do celów akademickich |
| Zainstalowany na: | do zainstalowania w razie potrzeby |
| Wersja: | |
| Email: | magd@icm.edu.pl |
| Lista oprogramowania | |
ECEPPAK służy do obliczania i minimalizacji energii pojedynczech makromolekuł, jak i wielu konformacji jednocześnie. Wykonuje przeszukiwanie konformacyjne używając algorytmu Monte-Carlo kierowanego elektrostatycznie, EDMC. Generuje mapy potencjału dla par kątów dwuściennych.
Jest to program utworzony przez grupę z Computational Biology Service Unit w Cornell Technical Center.
Krótka informacja autorów z listą referencji
Przykładowa lekcja - Generowanie konformacji i wyznaczanie energii
Przykładowa lekcja - Minimalizacja energii i zapisanie współrzędnych
Przykładowa lekcja - Przeszukiwanie konformacji z użyciem EDMC
Przykładowa lekcja - Uwzględnianie równowagi jonowej w przeszukiwaniu konformacyjnym
Powiązane pakiety:
Categories: Oprogramowanie | Bioinformatyka i obliczenia biomolekularne
