CE
From Centrum Komputerów Dużej Mocy, ICM Uniwersytet Warszawski
| CE w ICM | |
|---|---|
| Produkt: | CE |
| Producent: | I.N. Shindyalov and P.E. Bourne |
| Licencja: | darmowa do celów akademickich |
| Zainstalowany na: | amonit, kabestan, halo |
| Wersja: | 1.01 |
| Email: | lukas@icm.edu.pl |
| Lista oprogramowania | |
Program CE służy do porównywania struktur białkowych oraz wyznaczania ich alignmentow strukturalnych w oparciu o algorytm znajdowania podobnych fragmentów i rozszerzania dopasowania na sąsiadujące w łańcuchu CA aż do zadanego poziomu odcięcia. Program pozwala nałożyć na siebie dwie podane struktury, lub poszukiwać najlepiej dopasowanych do zadanego białka struktur w bazie.
Contents |
Ustawienie środowiska:
* use_ce
Dokumentacja:
- http://cl.sdsc.edu/ce.html
- more /opt/ce/README
Referencje:
- Shindyalov, I.N., Bourne, P.E. (1998) Protein structure alignment by incremental combinatorial extension (CE) of the optimal path. Protein Engineering 11, 739-747.
Instalacja:
- /opt/ce
