CDD
From Centrum Komputerów Dużej Mocy, ICM Uniwersytet Warszawski
| CDD w ICM | |
|---|---|
| Produkt: | Baza |
| Producent: | NCBI |
| Licencja: | darmowa do celów akademickich |
| Zainstalowany na: | halo |
| Wersja: | 2.4 |
| Email: | lukas@icm.edu.pl |
| Lista oprogramowania | |
Baza domen integrująca bazy SMART, Pfam-A, COG, KOG oraz własnych odkrytych przez grupę pracującą nad CDD, w postacji profili przygotowanych w NCBI. Baza jest przystosowana do przeszukiwania programem RPS-BLST.
Lokalizacja
*/opt/seqdb/CDD
Dostępne prekompilowane zestawy
All, Smart, Pfam, Cog, Kog.
Referencje
Marchler-Bauer A, Anderson JB, Cherukuri PF, DeWeese-Scott C, Geer LY, Gwadz M, He S, Hurwitz DI, Jackson JD, Ke Z, Lanczycki C, Liebert CA, Liu C, Lu F, Marchler GH, Mullokandov M, Shoemaker BA, Simonyan V, Song JS, Thiessen PA, Yamashita RA, Yin JJ, Zhang D, Bryant SH. CDD: a Conserved Domain Database for protein classification. Nucleic Acids Res. 2005;33 Database Issue:D192-6.
